Détection moléculaire et génotypage de la résistance à l’Azithromycine

Détection moléculaire et génotypage de Treponema pallidum résistant à l’Azithromycine en utilisant la méthode PCR conventionnelle et le séquençage de l’ADN.

Écouvillon, le liquide céphalo-rachidien (LCR) sang total, or tissu frais. LCR: volume minimum requis: 0,5 mL. Sang total: volume minimum requis: 0,5 mL. Tissu frias: volume minimum requis: 1-5 g. Pour d’autres types d’échantillons, veuillez appeler ou envoyer un courriel avant l’envoi.

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou qui ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient peuvent être rejetés.

Utiliser un écouvillon approprié, tel qu’un écouvillon Rayon ou un écouvillon Dacron pour le prélèvement d’échantillons sur les ulcères.

Les écouvillons peuvent être envoyer sèche ou dans un milieu de transport approprié, comme le milieu de transport viral.  Entreposer les échantillons au réfrigérateur ou les congeler jusqu’à leur envoi pour analyse.  Expédier les échantillons congelés sur glace sèche, et les échantillons réfrigérés sur glace humide.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Syphilis présumée.

Formulaire de demande d’analyse des infections sexuellement transmissibles et opportunistes dûment rempli, comprenant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur. Identifiant du patient (numéro de référence de l’échantillon), date de naissance et sexe. Date de prélèvement et test demandé.

On procède au génotypage des spécimens qui s’avèrent positifs au test de détection moléculaire par PCR conventionnelle, afin de déterminer s’ils sont résistants à l’azithromycine.

Méthodes et interprétation des résultats: Des méthodes de PCR conventionnelle sont réalisées sur des échantillons cliniques ciblant des gènes spécifiques de Treponema pallidum, notamment tp47, polA et bmp (1,2,3). Le gène de la ß-globine est amplifié en parallèle des cibles afin d’évaluer l’adéquation de l’échantillon, de vérifier la qualité de l’extraction de l’ADN et de confirmer le succès de l’amplification par PCR (4). Les échantillons positifs par PCR conventionnelle sont ensuite génotypés afin de détecter les mutations associées à la résistance à l’azithromycine.

20 jours civils.

1. Burstain JM, Grimprel E, Lukehart SA, Norgard MV, Radolf JD. Sensitive detection of Treponema pallidum by using the polymerase chain reaction. J Clin Microbiol. 1991 Jan;29(1):62-69. doi:10.1128/jcm.29.1.62-69.1991.
2. Liu H, Rodes B, Chen CY, Steiner B. New tests for syphilis: rational design of a PCR method for detection of Treponema pallidum in clinical specimens using unique regions of the DNA polymerase I gene. J Clin Microbiol. 2001 May;39(5):1941-1946. doi:10.1128/JCM.39.5.1941-1946.2001.
3. Pietravalle M, Pimpinelli F, Maini A, Capoluongo E, Felici C, D'Auria L, Di Carlo A, Ameglio F. Diagnostic relevance of polymerase chain reaction technology for T. pallidum in subjects with syphilis in different phases of infection. New Microbiol. 1999 Apr;22(2):99-104.
4. Keller GH, Manak MM, editors. DNA Probes: Background, Applications, Procedures. New York: Stockton Press; 1993.