Détection moléculaire par PCR quantitative

Détection du virus JC par PCR quantitative.

Le liquide céphalo-rachidien (LCR), pièces de biopsie du SNC fraîches ou tissus fixés.  Échantillon de LCR requis est 600 µL (minimum de 300 µL).  Le plasma, le sérum, le sang total, et les échantillons d’urine ne seront pas acceptés. Le volume minimal ne permet pas une répétition des analyses d’échantillons ayant un résultat équivoque.

Prélever le LCR dans un tube sec soumis aux conditions habituelles de ponction lombaire. 

Le LCR peut être conservé et expédié réfrigéré au LNM dans les 48 h suivant le prélèvement, sinon, il doit être conservé et expédié congelés. Les pièces de biopsie fraîches doivent être conservées au congélateur en tout temps et expédiées sur de la glace sèche. Les tissus fixés peuvent être conservés et expédiés à la température ambiante.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Cas présumé de leuco-encéphalopathie multifocale progressive (LEMP).

La requête d'analyse pour « ITS virales, polyome et herpèsvirus » comprend, pour l'expéditeur, le nom, l'adresse et le numéro de téléphone et, pour le patient, le nom-code, la date de naissance, le sexe, le no de référence de l'échantillon, le type d'échantillon, la date de prélèvement, le test requis et toute autre information clinique pertinente.

S/O

qPCR duplex modifiée basée sur la technologie TaqMan détectant le virus JC (1,2). Sensibilité analytique entre 10 et 100 copies du génome JC par test. Les résultats sont rapportés en nombre de copies par ml de spécimen. Aucune quantification possible sur les biopsies tissulaires. Veuillez noter que pour la détection du JCV dans les spécimens fixés au formol, la sensibilité du test est réduite et le virus peut ne pas être détecté.

14 jours civils. Des échantillons STAT peuvent être envoyés dans certaines circonstances. Veuillez communiquer avec le laboratoire pour vous renseigner sur les délais d'exécution plus courts.

1. Dumonceaux T.J., Mesa C., and Severini A. 2008. An internally controlled, triplex quantitative PCR assay for human polyomaviruses JC and BK. J. Clin Microbiol. 46:2829-2836.
2. Lamontagne B, Girard N, Boucher A, Labbé AC. Improved detection and quantitation of human BK polyomavirus by PCR assay. J Clin Microbiol. 2011 Jul;49(7):2778.