Détection moléculaire du virus de l'encéphalite équine de l'Est par RT-PCR
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Détection moléculaire du virus de l'encéphalite équine de l'Est par RT-PCR.
- Encéphalite équine de l'Est
Les échantillons de sérum sont préférables; toutefois, les tests peuvent aussi être réalisés sur des échantillons de plasma ou de liquide céphalo-rachidien (LCR). L’analyse d’autres liquides et tissus corporels pourrait être envisagée; veuillez communiquer avec le laboratoire de diagnostic des zoonoses virales pour vérifier si d’autres échantillons peuvent être utilisés. Le volume minimum est de 600 µl.
Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum – soumettre dans un tube en « O » de 2 ml.
Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection par le virus de l’encéphalite équine de l’Est soupçonnée.
Formulaire de demande de tests sérologiques pour certains agents pathogènes viraux transmis par vecteurs et agents zoonotiques, dûment rempli, comprenant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur, ainsi que le nom et/ou l’identifiant du patient (numéro de référence de l’échantillon), sa date de naissance, le ou les tests demandés, la date de prélèvement de l’échantillon, la date d’apparition des symptômes, le type d’échantillon, ainsi que les antécédents cliniques et les antécédents de voyage du patient.
Il est à noter qu’il est crucial d’indiquer la date de prélèvement de l’échantillon et la date d’apparition des symptômes pour aider à déterminer les analyses à effectuer et pour l’interprétation des résultats.
Ce test est considéré comme expérimental, car il n’a pas été validé ou vérifié de manière approfondie.
Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une épreuve mise au point en laboratoire qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée, car il n’y a pas de panel bien caractérisé.
Détection du virus EEE par RT-PCR en temps réel TaqMan. Deux épreuves uniplex distinctes ciblant deux régions génomiques distinctes sont réalisées; un résultat est jugé positif si les deux cibles sont détectées et si chaque valeur Ct se situe à l’intérieur du seuil préétabli pour chaque épreuve. Si une seule des cibles est détectée, le test est répété et/ou d’autres plateformes d’analyse peuvent être utilisées pour permettre l’interprétation du résultat.
21 jours civils après la date de réception de l’échantillon.
- Armstrong, P.M., Prince, N., & Andreadis, T.G. (2012). Development of a multi-target TaqMan assay to detect Eastern Equine Encephalitis virus variants in mosquitoes. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 12(N10), 872-876.
- Hull, R., Nattanmai, S., Kramer, L.D., Bernard, K.A., Tavakoli, N.P. (2008). A duplex real-time RT-PCR assay for the detection of St. Louis encephalitis and Eastern equine encephalitis viruses. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 62(3), 272-279.